BOD5的測定是一個生物化學耗氧過程，水樣中的微生物以水中有機物為營養(yǎng)生長繁殖的同時，分解有機物并消耗了水中的溶解氧，因此水樣中必須含有一定數量的對其中有機物有降解能力的微生物。
工業(yè)廢水中一般都含有數量不等的有毒物質，這些有毒物質會對微生物的活動產生抑制作用，因此工業(yè)廢水中自有微生物的數量很少甚至根本沒有。如果采用測定微生物含量豐富的城市污水的普通方法，可能就檢測不到廢水中真正有機物的含量，至少是偏低。比如經高溫和滅菌處理及pH過高或過低的水樣，除了需要采取進行降溫、還原殺菌劑或調整pH值等預處理措施外，為保證測定BOD5時的準確性，也必須進行有效接種。
測定工業(yè)廢水的BOD5時，如果毒性物質含量太大，有時還要用藥劑予以去除;如果廢水呈酸性或堿性，還要先進行中和處理;而且通常水樣要經過稀釋，然后才能采用標準稀釋法測定。向水樣中水加入適量含經過馴化的好氧微生物的接種液(如處理這種工業(yè)廢水的曝氣池混合液)，就是為了使水樣中含有一定數量的對有機物具有降解能力的微生物。在滿足其他測定BOD5的條件下，利用這些微生物分解工業(yè)廢水中的有機物，測定水樣培養(yǎng)5d的耗氧量，即可得到工業(yè)廢水的BOD5值。
污水處理場的曝氣池混合液或二沉池出水是測定進入污水處理廠的廢水BOD5時的理想的微生物種源。直接用生活污水接種，因其中溶解氧很少甚至沒有，容易出現厭氧微生物，需要長時間培養(yǎng)馴化，因此，這種經過馴化的接種液僅適用于作為特定需要的某些工業(yè)廢水。
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